在光之国，赛克斯正坐在一个角落默默想着什么，初代等人走了过来，关心地问道：“怎么了，赛克斯，在那里蒙蒙不乐？”
“奥特曼前辈，不知道在地球的防卫队怎么样了？好想念啊！”赛克斯说道。
“那就回去看看吧！”赛文说道。
“嗯，不过在这之前，前辈们，我想知道你们当时到地球的时候的防卫队。”赛克斯说道。
“真的想知道吗？这些在地球可是机密啊！”杰克说道。
“不过也无妨，就像从我初到地球上加入的科学特搜队说起吧！”奥特曼说道。
“嗯！”赛克斯点点头。
（科学特搜队队歌）科学特别搜查队，简称科学特搜队，是奥特曼的后盾，位于东京近郊，基地由指挥中心和“威托”发射平台两部分组成，表面看上去是钢筋混凝土，但内部却用特种合金进行了加固以抵御来自外部的攻击。
科特队由科学特别搜查队日本分部全队共有5名正式成员，之中又加入一名见习队员，他们是队长村松敏夫、早田进、井手光宏、岚大助、富士明子和见习队员星野勇。
队长村松敏夫是科特别搜查队日本分部队长，下达命令简明扼要、从不拖泥带水，遇到突发事件时能够毫不慌张、沉着应付，当面遇到宇宙人时能够保持镇定，陷入困境时能够冷静地找寻出路。平时工作中严肃又不失和蔼，很有民主作风，所以受到队员们的爱戴，使得整个科特队就像小家庭一样团结。
队员井手光宏是科学特别搜查队日本分部队员，负责队内日常的设备维修和新式武器的开发。一方面，他是真正的技术精英，其个人科学发明无论从数量上还是性能上高得都有些离谱，而且经常发挥重要的作用，主要有单人防护罩、宇宙语翻译机和火星133号射线枪、新型火箭筒、光谱α.β.γ射线、合金溶解机、氢弹探测器和强力干燥炸弹、跟踪发信机、地底战车Pelucidar、QX射线枪、闪光X型枪榴弹、宇宙坦克S80。另一方面，他又是一个有着细腻感情的人：《石油SOS》中为了弥补自己的失误而不顾一切地参与灭火、《我的故乡是地球》中拒绝向变成怪兽的宇航员贾米拉射击，《虚幻的雪山》中因为自己是一个孤儿所以同情同样出身的的女孩小雪，《小英雄》中从一开始的悲观泄气丧失自信、到最后重新燃起斗志……更不用说他那每集夸张的动作、搞笑的言语、丰富的表情。虽然有时会有些装腔作势、唯唯喏喏，但从某种意义上说他是全剧中刻划得最为出色的一个角色，甚至超过作为主角的早田。此外，他是历代奥特曼中击杀怪兽宇宙人数量最多的队员。
队员岚大助是科学特别搜查队日本支部队员，优秀的射击专家，队内重要的武器一般都是他亲自操纵射击，比如最后一集中那发决定胜利的火箭弹。性格上直爽开朗，责任感很强，敢作敢为。但是思维上基本是直线形的，不免有些鲁莽冲动、粗心大意，所以有时会遭到宇宙人或者怪兽的偷袭。也是因为这些特点，所以和性格与其截然相反的井手关系一直不是太好，剧中他们时不时的发生一些小冲突，但总体上岚是一个非常称职的战斗队员。
队员富士明子是科学特别搜查队日本分部唯一的女性队员，主要负责队内的通信工作。性格上是女性常有的那种温柔体贴，除了本身业务工作外，家务活也很擅长，烹饪、茶道样样得心应手，其咖啡服务成为了其他男性队员们每日的“必修课”。生活方面非常喜爱购物，尤其对珍珠－她的诞生石有一种特殊的喜好，平时和井手队员是很要好的朋友。总而言之，她是一个非常端庄、典雅的传统日本女子，有一种让人感觉很特殊的、朴素的美感。
见习队员星野勇是一个梦想成为科学特别搜查队队员的11岁少年，拥有自由进出科学特别搜查队基地的权利，和富士明子队员关系异常的亲近甚至就像一对姐弟。虽然仅仅是一个普通的孩子，但却有着远远超出他年龄的才能和勇气，从参与事件的调查到紧急情况下保持镇定、听从指挥，其所有的表现丝毫不亚于作为成年人的科特队队员。也因为他的突出贡献，所以村松队长特别允许他穿上科学特别搜查队制服，成为见习队员。
最后就是我们的主角队员早田进了，科学特别搜查队日本分部队员，也是奥特曼的人类化身。行动上雷厉风行，分析和观察问题冷静细致，做事果断干脆，基本上没有看到过他有过多余的话或动作。深得队长和众队员的信任和友好，不过有时侯也会犯一些粗心的小错误，比如有一次中匆忙中将勺子当成贝塔魔棒变身。
还有一个小分队的队长，他也就是我们熟知的GUYS的队长迫水真吾，他担任科学特别搜查队宇宙探索队一支小分队的队长。一次任务中，他在冥王星轨道上遭到了谜之圆盘的袭击，但被佐菲奥特曼所救，后来，为了回报奥特曼的心意回到地球。以GUYS的队长的身份参加战斗。
当然科特队的装备也是有许多的。
威托是科特队的主力交通工具和武器，能够垂直起降的万能喷气式飞机，最多可以搭载6人，承担了名目繁多的诸如灭火、救援、巡逻、运输甚至为村松队长提供私人服务等民事任务，到攻击怪兽等战斗任务，在经过岩本博士的改造后又具有在大气层外飞行的能力。机载武器主要是导弹、炸弹、火箭弹，随后又为火星133号射线枪配备了一个专门的发射口。
小型“威托”有着和“威托”相类似的武器但是外表远比其要光滑流畅，机动性也更加灵活，主要负责侦察、巡逻和搜索，最大载员2人。而早田和奥特曼初次接触时驾驶的就是它。
当然还有科特队专用车、小型潜艇还有地下站车“贝鲁特”这些载具，除此之外科特队每个人身上也都配备射线枪，每一把射线枪都可以发射发射呈锯齿状的能量光束。单发杀伤威力较小但是集中数支该枪向同一点射击就可以获得可观的威力。可搭配麻醉弹、UNG麻醉弹、火花8、无重力弹等使用，另外还有小型射线炮、火星133号射线枪还有先锋08等武器。
科特队在奥特曼离开后也解散了，后来的就是奥特警备队。
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